ARCHITEKci:
- Izydor Affaita (Starszy), Izydor Affaita (Młodszy)
- Augustyn Locci
- Tylman z Gameren (?)
Uwaga: W literaturze pojawia się kilak wersji autorstwa kościoła i klasztoru, m.in. Affaita Starszy miał być autorem zmodyfikowanego projektu Locciego i według tego projektu rozpoczęto budowę kościoła, który jednak ostatecznie ukończono według projektu Locciego. Według innej wersji autorem pierwotnej wersji miał być Affaita Młodszy, a Locci zmodyfikował ten projekt.
BUDOWA kościoła:
1683-94
Fundatorem kościoła-wotum dziękczynnego za zwycięstwo pod Chocimiem oraz kolejnego pod Wiedniem był król Jan III Sobieski.
Kościół w stylu baroku toskańskiego o trójprzęsłowej nawie z skromną fasadą podzieloną pilastrami z herbem Sobieskich w tympanonie powstał wraz z przylegającym do niego od wschodu klasztorem kapucynów, którzy z nadania królewskiego otrzymali dużą posesję przy ul. Miodowej. Na tylnej części tej posesji powstał cmentarz oo kapucynów.
W krypcie kościelnej w 1696 r. został pochowany fundator kościoła i klasztoru - król Jan III Sobieski.
W 1733 jego ciało, wraz z ciałem zmarłego w tym samym roku Augusta II Mocnego zostało przeniesione do katedry na Wawelu.
Rozbudowa:
w 1736 dobudowano do kościoła wg projektu J. D. Jaucha kaplicę przeznaczoną na urnę z wnętrznościami Augusta II Mocnego. W 1829 r, w przebudowanej kaplicy (koniec prac w 1830) złożono również sarkofag z sercem Jana III Sobieskiego (przechowywany do tej pory w archiwum klasztoru).
Po kasacie klasztoru w 1864 w 1886 r. przy kościele została utworzona parafia.
Rozbiórka klasztoru:
w 1889 przylegający do kościoła klasztor rozebrano, a w jego miejscu wytyczono ul. Kapucyńską.
Na tyłach kościoła powstała wówczas dwupiętrowa plebania.
W 1926 kościół odrestaurowano.
Zniszczony:
w 1944
Odbudowany:
w latach 1945-46